Python高级技术之:`Dask`的`DataFrame`:如何处理超出内存的大型数据集。

各位观众老爷,早上好/下午好/晚上好!今天咱们来聊聊Python世界里处理超大型数据集的秘密武器——Dask DataFrame。 啥?你的数据动不动就GB甚至TB级别,Pandas直接给你跪了?别慌,Dask DataFrame就是来拯救你的!

第一部分:Dask DataFrame是个啥?

简单来说,Dask DataFrame就像一个“升级版”的Pandas DataFrame。 Pandas把数据都放在内存里,内存不够就歇菜;而Dask DataFrame聪明多了,它把数据分成很多小块(partitions),可以放在硬盘上,需要的时候再读到内存里计算。这样,即使你的数据比内存大得多,也能轻松处理。

你可以把Dask DataFrame想象成一个施工队,Pandas DataFrame是单打独斗的包工头,啥都自己干;Dask DataFrame是总指挥,把任务分解成小块,分配给不同的工人(partitions)并行处理,最后再把结果汇总起来。人多力量大嘛!

第二部分:为啥要用Dask DataFrame?

用Dask DataFrame的好处简直不要太多:

  • 处理超大型数据集: 这是最核心的功能,内存不够用?Dask DataFrame表示毫无压力。
  • 并行计算: Dask能充分利用你的CPU核心,加速计算过程。
  • 熟悉的使用方式: Dask DataFrame的API和Pandas DataFrame非常相似,学习成本很低,几乎可以无缝切换。
  • 延迟计算: Dask采用延迟计算(lazy evaluation)的策略,只有在真正需要结果的时候才开始计算,可以避免不必要的计算,提高效率。
  • 与Dask生态系统的整合: Dask可以和其他Dask组件(如Dask Array、Dask ML)无缝整合,构建更强大的数据处理流程。

第三部分:Dask DataFrame上手实战

光说不练假把式,咱们来点真格的。

  1. 安装Dask:

    pip install dask[dataframe]

    或者直接安装全部Dask依赖:

    pip install dask
  2. 创建Dask DataFrame:

    • 从Pandas DataFrame创建:

      import pandas as pd
      import dask.dataframe as dd
      
      # 创建一个Pandas DataFrame
      df_pandas = pd.DataFrame({'A': [1, 2, 3, 4, 5],
                               'B': ['a', 'b', 'c', 'd', 'e'],
                               'C': [0.1, 0.2, 0.3, 0.4, 0.5]})
      
      # 从Pandas DataFrame创建Dask DataFrame
      df_dask = dd.from_pandas(df_pandas, npartitions=2) # 将数据分成2个partitions
      
      print(df_dask)

      注意 npartitions 参数,它决定了数据被分成多少块。 分的越多,并行度越高,但也会增加调度开销,需要根据实际情况调整。
      输出结果类似:

      Dask DataFrame Structure:
                       A     B    C
      npartitions=2
      0                int64 object  float64
      2                  ...    ...      ...
      Dask Name: from_pandas, dtype: object

      注意,这里只是创建了Dask DataFrame的“蓝图”,并没有真正开始计算。

    • 从CSV文件创建:

      这是最常用的方式,毕竟数据一般都存在文件里。

      import dask.dataframe as dd
      
      # 从CSV文件创建Dask DataFrame
      df_dask = dd.read_csv('my_large_data.csv', assume_missing=True) # 假设有缺失值
      print(df_dask)

      assume_missing=True 参数告诉Dask,CSV文件中可能存在缺失值,这样Dask会更智能地处理数据类型。 当然你也可以指定数据类型,比如:

      df_dask = dd.read_csv('my_large_data.csv', dtype={'col1': 'int64', 'col2': 'float64', 'col3': 'object'})

      dtype参数可以强制指定每一列的数据类型,避免Dask自动推断错误。

      你还可以使用通配符读取多个CSV文件:

      df_dask = dd.read_csv('data_*.csv') # 读取所有以"data_"开头的CSV文件
    • 从Parquet文件创建:

      Parquet是一种列式存储格式,适合存储大型数据集,读取速度更快。

      import dask.dataframe as dd
      
      # 从Parquet文件创建Dask DataFrame
      df_dask = dd.read_parquet('my_large_data.parquet')
      print(df_dask)
  3. Dask DataFrame基本操作:

    Dask DataFrame的API和Pandas DataFrame非常相似,你可以像使用Pandas一样使用Dask。

    • 查看数据:

      # 查看前几行数据
      print(df_dask.head())
      
      # 查看数据信息
      print(df_dask.info())

      注意: head() 函数会触发计算,将一部分数据加载到内存中。 info()函数也会进行一些计算来推断数据类型和统计信息。

    • 选择列:

      # 选择单列
      col_a = df_dask['A']
      print(col_a)
      
      # 选择多列
      cols_ab = df_dask[['A', 'B']]
      print(cols_ab)
    • 过滤数据:

      # 过滤数据
      filtered_df = df_dask[df_dask['A'] > 2]
      print(filtered_df)
    • 新增列:

      # 新增列
      df_dask['D'] = df_dask['A'] + df_dask['C']
      print(df_dask)
    • 分组聚合:

      # 分组聚合
      grouped_df = df_dask.groupby('B')['A'].mean()
      print(grouped_df)

      注意: 分组聚合操作通常会涉及到数据洗牌(shuffling),Dask会将数据重新分配到不同的partitions,这可能会比较耗时。

    • 排序:

      # 排序
      sorted_df = df_dask.sort_values('A')
      print(sorted_df)

      注意: 排序操作也会涉及到数据洗牌,尽量避免对大型数据集进行排序。

  4. 计算:

    Dask采用延迟计算策略,所以上面的操作只是构建了计算图,并没有真正执行。 要想得到结果,需要调用 compute() 函数。

    # 计算结果
    result = grouped_df.compute()
    print(result)

    compute() 函数会将计算图提交给Dask调度器,Dask会将任务分配到不同的partitions并行执行,最后将结果汇总起来。

    重要提示: compute() 函数会把所有数据加载到内存中,如果数据太大,可能会导致内存溢出。 所以,在调用 compute() 之前,一定要确保结果集的大小在可控范围内。

  5. 持久化:

    如果你需要多次使用同一个Dask DataFrame,可以将其持久化到内存或硬盘上,避免重复计算。

    # 持久化到内存
    df_dask = df_dask.persist()
    
    # 或者
    from dask import persist
    df_dask = persist(df_dask)[0]

    persist() 函数会将Dask DataFrame的中间结果存储在内存中,下次使用时直接从内存读取,速度更快。 如果内存不够,Dask会自动将数据溢出到硬盘上。

    你也可以将Dask DataFrame存储到硬盘上,例如存储为Parquet文件:

    # 存储为Parquet文件
    df_dask.to_parquet('my_dask_data.parquet')

第四部分:Dask DataFrame高级技巧

  1. 自定义函数:

    你可以使用 map_partitions() 函数将自定义函数应用到每个partition上。

    import dask.dataframe as dd
    import pandas as pd
    
    def my_function(df):
       # 自定义函数,例如将A列的值乘以2
       df['A_multiplied'] = df['A'] * 2
       return df
    
    # 创建Dask DataFrame
    df_dask = dd.read_csv('my_large_data.csv')
    
    # 应用自定义函数
    df_dask = df_dask.map_partitions(my_function)
    
    # 计算结果
    print(df_dask.head())
  2. 并行计算优化:

    • 调整npartitions参数: 根据你的CPU核心数和数据大小,调整npartitions参数,找到最佳的并行度。
    • 使用Dask Dashboard: Dask Dashboard可以监控Dask的计算过程,帮助你发现性能瓶颈。

      from dask.distributed import Client
      
      # 启动Dask Client
      client = Client() # 默认会使用所有CPU核心
      
      # 执行计算
      result = df_dask.groupby('B')['A'].mean().compute()
      
      # 关闭Dask Client
      client.close()

      然后在浏览器中打开Dask Dashboard的地址(通常是 http://localhost:8787),就可以看到Dask的计算过程了。

    • 避免不必要的数据洗牌: 数据洗牌会消耗大量时间和资源,尽量避免在大型数据集上进行排序、分组等操作。
  3. 与Dask生态系统整合:

    Dask可以和其他Dask组件(如Dask Array、Dask ML)无缝整合,构建更强大的数据处理流程。 例如,你可以使用Dask Array处理大型数组,然后将结果传递给Dask DataFrame进行分析。

第五部分:Dask DataFrame注意事项

  • 内存管理: 虽然Dask可以将数据放在硬盘上,但内存仍然是关键资源。 尽量避免一次性加载大量数据到内存中,合理使用 persist() 函数。
  • 数据类型: Dask DataFrame对数据类型要求比较严格,需要确保数据类型一致。 可以使用 dtype 参数强制指定数据类型。
  • 计算图优化: Dask会自动优化计算图,但有时候也需要手动优化。 可以使用 dask.optimize() 函数手动优化计算图。
  • 错误处理: Dask DataFrame的错误信息可能比较复杂,需要仔细分析。 可以使用 try...except 语句捕获异常。

第六部分:Dask DataFrame VS Pandas DataFrame

特性 Dask DataFrame Pandas DataFrame
数据大小 处理超出内存的大型数据集 只能处理内存中的数据集
计算方式 延迟计算,并行计算 立即计算,单线程计算
数据存储 可以存储在硬盘上 必须存储在内存中
API 与Pandas DataFrame类似 常用数据分析和处理工具
适用场景 大型数据集的分析和处理,需要并行计算的场景 小型数据集的快速分析和原型设计
复杂度和学习曲线 相对复杂,需要了解Dask的基本概念和API 简单易用,学习曲线平缓

第七部分:总结

Dask DataFrame是处理超大型数据集的利器,它可以让你轻松应对内存不足的挑战,利用并行计算加速数据处理过程。 虽然Dask DataFrame的学习曲线相对陡峭,但一旦掌握,你就能在数据分析的道路上更上一层楼。 记住,熟能生巧,多练习,多踩坑,你也能成为Dask高手!

今天的讲座就到这里,感谢各位观众老爷的观看!下次再见!

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