大模型在基因组学中的应用：将DNA序列视为语言进行预训练的Token化策略 大家好，今天我们来探讨一个热门且极具潜力的领域：大模型在基因组学中的应用。更具体地说，我们将深入研究如何将DNA序列视为一种语言，并探讨用于预训练大型模型的各种Token化策略。 1. 基因组学与自然语言处理的交汇 基因组学，作为研究生物体完整基因组的学科，产生着海量的DNA序列数据。而自然语言处理 (NLP) 领域，专注于理解和生成人类语言，近年来因Transformer架构和预训练模型的崛起而取得了显著进展。这两种看似截然不同的领域，其实存在着深刻的联系。 我们可以将DNA序列视为一种由四个“字母”组成的语言：腺嘌呤 (A)、鸟嘌呤 (G)、胞嘧啶 (C) 和胸腺嘧啶 (T)。这些碱基以特定的顺序排列，编码着生物体的遗传信息。如同自然语言中的单词和句子，DNA序列中的特定模式和结构蕴含着复杂的生物学意义，例如基因、调控元件和非编码区域。 因此，借鉴 NLP 的方法，我们可以利用大模型来学习DNA序列的潜在模式，从而预测基因功能、疾病风险和药物反应等。 2. Token化：DNA序列的“词汇表” 在 NLP …